中心由学校分管校长领导，实行中心主任负责制，各部视工作需要配备部长或副部长若干名，各部人员按照实训项目和学生数进行合理分配，明确岗位职责。
在中心党总支的领导下，中心定期召开党政联席会，集体决策中心发展重大事项，中心党总支监督中心主任正确行使权利。
中心党政办公室负责中心日常事务；各类实训教学的安排，统计学生实训成绩。中心接受学校教务处实践教学科根据专业培养计划下达的实训课程，同时接受学生自由选训的实训项目和各院（系）课外兴趣小组的科技活动，中心统一由党政办公室进行协调安排各类实训项目，统一安排教师的教学任务。
各实训部落实实训教学计划，完成各项实习指导工作，为教师和学生提供开放实验平台服务，总结实训经验、反馈存在问题，维护仪器、设备的正常运行。